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Extraction de motifs en utilisant des techniques de vecteurs de bits

La compréhension du fonctionnement d'un tissu, qu’il soit dans un état normal ou pathologique, implique généralement l'analyse de l'expression des gènes qui lui sont spécifiques. Après identification de ces gènes, l'étape suivante consiste souvent à déterminer la raison de cette spécificité tissulaire. Elle peut trouver son origine à différents niveaux : régulation de l'expression du gène, stabilité de son ARN messager (ARNm) ou de sa protéine, le premier cas étant le plus fréquent. La première étape dans l'expression des gènes est l'initiation de la transcription qui est un point de contrôle important.

D'un point de vue pathologique, les défauts de régulation de la transcription de certains gènes sont l'une des causes majeures de cancer. L'analyse des régions promotrices des gènes ayant une spécificité tissulaire commune est donc incontournable pour comprendre la spécificité de leur transcription et leurs éventuelles dérégulation. De plus, lorsqu'un groupe de gènes est spécifique à un tissu, l'une des suppositions naturelles est que cette spécificité est probablement due à une régulation commune de ces gènes… donc qu'ils ont des éléments de régulation communs. De nombreuses études portant sur la prédiction de promoteurs et la recherche des éléments de régulation de ces régions ont été menées; la plupart, tout comme la nôtre, commencent par une étape d’analyse bio-informatique.

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